V posledních deseti letech se výzkum endotoxinu soustředil především na dráhu biosyntézy lipidů E. coli K-12.

V procesu biosyntézy buněčného povrchu je UDP-N-acetylglukosamin (UDP-GlcNAc) důležitým meziproduktem a společným prekurzorem peptidoglykanu a lipidu A, který hraje důležitou roli při syntéze povrchových polysacharidů. V jádru LPS hrají polysacharidy a О CleNAc klíčovou roli ve vazbě antigenu.

UDP-GlcN a nosičový protein kyseliny β-hydroxytetradekanové ( β- Prekurzorové molekuly syntézy lipidu A, jako je hydroxymyristoyl-acylový nosný protein, hydroxymyristoyl-ACP), generují lipid A prostřednictvím následujících sérií reakcí:

1. Vznik UDP - monoacyl acetylglukosaminu

UDP-GlcNAc je β-hydroxytetradekanová-apolipoprotein β Acylací hydroxytetradekanové kyseliny vzniká UDP-3-monoacyl-GleNAc. Tato reakce je katalyzována acyltransferázou. Gen lax A umístěný na 4 minutách chromozomu kóduje acyltransferázu.

2. Produkce UDP-2, 3-diacyl glukosaminu a lipidu X

UDP-monoacylacetylglukosamin je deacetylován na aminoskupině za katalýzy N-deacetylázy kódované genem lpxC a poté převeden na aminoskupinu za katalýzy produktu kódovaného genem lpxD kyseliny β-hydroxytetradekanové, čímž vzniká UDP - diacylglukosamin (UDP - 2, 3 - diacyl - GlcN). UDP z UDP-lipoacylglukózy se odstraňuje pyrofosfatázou za vzniku 1-fosfo-2,3-dilipoacylglukosaminu, který je běžně známý jako lipid X (lipid x).

3. Tvorba lipidů Ⅳa

UDP-2, 3-diacylglukosamin a lipid X procházejí β- Pyrofosfátová vazba 1,6 je spojena a kondenzována za vzniku lipidové kostry. V této době jsou v každé cukerné skupině 2 kyselina β-hydroxytetradekanová, redukující glukosamin, má fosfátovou skupinu v poloze C-1. Tato reakce je katalyzována proteinem kódovaným genem lpxB. Poté, za katalýzy specifické kinázy, je poloha C-4 neredukujícího glukosaminu fosforylována za vzniku 1,4'-difosfáttetradecylglukosamin disacharidu, konkrétně lipidu Ⅳa (lipid Ⅳa).

4. Produkce lipidu A

Přechod z lipidu Ⅳa na lipid A vyžaduje přidání KDO v poloze C-6' neredukujícího glukosaminu a poté přidání dvou nasycených mastných kyselin a polárních skupin, jako je fosfát. Konkrétní mechanismus této reakce je stále nejasný.