Systémy zprostředkované hostitelem lze rozdělit na systémy zprostředkované buňkami a systémy zprostředkované humorem. První označuje neutrofily, krevní destičky, monocyty, makrofágy, lymfocyty, bazofily, žírné buňky, dendritické buňky a endoteliální buňky; Systém tělních tekutin je komplementární a koagulační systém. Endotoxin působí na kmenově zprostředkovaný systém. Na jedné straně plní svou obrannou funkci, na straně druhé vyvolává i některé patologické procesy.

1. Vliv na systém komplementu

Molekuly endotoxinu na bakteriích, molekuly volného endotoxinu a analogy lipidu A mohou aktivovat komplement, aktivovat komplement klasickými i alternativními způsoby, hrát přirozenou imunitní odpověď a polykat patogeny a jejich produkty; V procesu imunitní odpovědi může aktivovat získanou imunitní odpověď, vyvolat expresi různých cytokinů a přinést hostiteli příznivé a nepříznivé účinky.

2. Vliv na systém srážení krve

Endotoxin může ovlivnit systém srážení krve v těle, což vede k výskytu diseminované intravaskulární koagulace. Na zvířecích modelech, lidském těle i experimenty in vitro bylo prokázáno, že endotoxin může aktivovat Hagemanův faktor (koagulační faktor III, kontaktní faktor) a aktivovat endogenní koagulační dráhu. Na druhé straně může endotoxin také aktivovat exogenní koagulační dráhu. Prokoagulační aktivita endotoxinu se projevuje především v lipidu A. Po inaktivaci aktivity endotoxinu polymyxinem B mizí i jeho prokoagulační účinek.