Jakmile je O antigenový polymer spojen s jádrem lipidu A, zastaví polymerační reakci. To znamená, že spojovací reakce může ukončit polymerační reakci. Jak jádro lipidu A, tak lipopolysacharid s různě dlouhými opakujícími se jednotkami mohou být účinně přeneseny na vnější membránu. Proto lze molekulární velikost lipopolysacharidu zjistit pomocí SDS-PAGE, což je způsobeno spíše rozdílem v systému biosyntézy než faktorem výstupního systému.

Distribuce postranního řetězce O antigenu v různých bakteriích je různá, z nichž některé obsahují přibližně 20 opakujících se jednotek a některé z nich mohou mít přibližně 100 opakujících se jednotek. Při SDS-PAGE elektroforéze se odráží rozdíl v intenzitě barvení stříbrem u různých molekul různých druhů bakterií. Důvodem rozdílné distribuce délky postranního řetězce O antigenu u různých bakterií může být to, že v procesu polykondenzační nebo spojovací reakce O antigenu existuje faktor výběru velikosti. Wzz (tj. Rol nebo Cld) je důležitý protein, který reguluje distribuci délky postranního řetězce u bakterií, které syntetizují antigeny prostřednictvím Wzy dependentní dráhy, ale jeho specifický mechanismus je stále nejasný.