Různé složení endotoxinu může vést ke třem formám bakteriálního fenotypu, jmenovitě hladkému typu, drsnému typu a střednímu typu (také nazývanému mucus typ). Když je jádrová polysacharidová složka redukována nebo poškozena, je vzhled kolonií bakteriální kultury drsný, proto se nazývá hrubý mutant (drsný-LPS, R), který může být nazýván Rb-LPS, Rc-LPS, Rd-LPS, Re -LPS podle stupně defektu jádrového polysacharidu, jak je znázorněno na obrázku .

Elektronový mikroskop Escherichia coli LPS s hladkými koloniemi má štíhlou šňůrovitou strukturu, zatímco hrubý typ Escherichia coli LPS je většinou kruhová struktura. Vzhledem k různé délce jeho cukerného řetězce budou produkovány různé efekty stérické zábrany, které ovlivní rozpoznání a fagocytózu LPS a CNB imunitními buňkami těla, takže hostitel na něj bude mít různé imunitní účinky a ovlivní odstraňování bakterií tělem.

Cukerný řetězec drsného typu je krátký a je snadné jej spolknout fagocyty, jako jsou profesní fagocyty: neutrofily a makrofágy, které lze snadno odstranit bakteriemi drsného typu; Hladký cukerný řetězec je dlouhý, má sterickou zábranu, není snadné jej spolknout fagocyty a kombinovat s komplementem a snadno uniká imunitní reakci těla na něj.